AIPJ bekerja sama dengan lembaga hukum dan keadilan tingkat nasional di Indonesia dan Australia.
National Development Planning Agency
The Supreme Court
The Judicial Commission
The Corruption Eradication Commission
Lembaga Kajian dan Advokasi untuk Independensi Peradilan (LeIP)
Pusat Studi Hukum dan Kebijakan (PSHK)
Lembaga Bantuan Hukum Jakarta (LBH Jakarta)
Yayasan Lembaga Bantuan Hukum APIK Jakarta (YLBH APIK Jakarta)
Masyarakat Pemantau Peradilan Indonesia FH-UI (MaPPI FH UI)
Indonesia Corruption Watch (ICW)
Sentra Advokasi Perempuan, Difabel dan Anak (SAPDA)
Sasana Integrasi dan Advokasi Difabel (SIGAB)
DFAT
The Federal Court of Australia
Family Court of Australia
Judicial Commission of New South Wales
The Asia Foundation
Pembaruan Peradilan
Provincial Government of Aceh
Provincial Government of NTB
Provincial Government of South Sulawesi
AIPJ bekerja sama dengan lembaga hukum dan keadilan tingkat nasional di Indonesia dan Australia.
Mahkamah Agung Republik Indonesia
DFAT
Kejaksaan Agung Republik Indonesia
Kementrian Hukum dan HAM (Badan Pembinaan Hukum Nasional, BPHN)
Kementerian Dalam Negeri RI, Direktorat Jenderal Kependudukan dan Catatan Sipil
Kementrian Agama RI, Direktorat Jenderal Bimbingan Masyarakat Islam
Badan Perencanaan Pembangunan Nasional Republik Indonesia
Komisi Yudisial Republik Indonesia
Komisi Pemberantasan Korupsi
Komisi Kejaksaan
Pemberdayaan Perempuan Kepala Keluarga (PEKKA)
Pusat Kajian Perlindungan Anak UI
Yayasan Lembaga Bantuan Hukum Indonesia (YLBHI)
Mitra Netra
The Federal Court of Australia
The Family Court of Australia
The Attorney General's Department of Australia (AGD)
Australia Human Rights Commission
Australian Commission for Law Enforcement Integrity (ACLEI)
Judicial Commission of New South Wales
The Asia Foundation
Mitra Masyarakat Sipil, yang dikelola oleh The Asia Foundation
Indonesia Corruption Watch (ICW)
Lembaga Kajian dan Advokasi untuk Independensi Peradilan (LeIP)
Yayasan Lembaga Bantuan Hukum APIK Jakarta (YLBH APIK Jakarta)
Lembaga Bantuan Hukum Jakarta (LBH Jakarta)
Masyarakat Pemantau Peradilan Indonesia FH-UI (MaPPI FH UI)
Pusat Studi Hukum dan Kebijakan (PSHK)
Sentra Advokasi Perempuan, Difabel dan Anak (SAPDA)
Sasana Integrasi dan Advokasi Difabel (SIGAB)
Lembaga Bantuan Hukum APIK Makassar (LBH APIK Makassar)
Lembaga Bantuan Hukum Makassar (LBH Makassar)
Lembaga Perlindungan Anak Nusa Tenggara Barat (LPA NTB)
Lembaga Pemantau Independen - Pengadaan Barang dan Jasa Kota Makassar (LPI-PBJ Makassar)
Perhimpunan Bantuan Hukum Nusa Tenggara (PBH-NUSRA)
Solidaritas Masyarakat untuk Transparansi NTB (SOMASI)
Yayasan Wali Ati (YASALTI)
Yayasan Sanggar Suara Perempuan Soe NTT (YSSP)
AIPJ juga bekerja dengan tim asistensi reformasi berikut:

Yayasan Sanggar Suara Perempuan-SoE NTT (YSSP) adalah organisasi masyarakat sipil di Soe, NTT, dengan misi lembaga: (1) mewujudkan pendampingan dan pelayanan terhadap perempuan dan anak korban kekerasan secara terpadu dan prima yang di dukung oleh sarana prasarana yang memadai sesuai dengan kebutuhan korban; (2) meningkatkan pengetahuan, wawasan dan kesadaran perempuan laki-laki tentang isu hak asasi manusia, kesehatan reproduksi, kekerasan terhadap perempuan dan gender agar perempuan memiliki akses dan kontrol terhadap berbagai program pembangunan dan posisi strategis baik dalam lembaga formal maupun non formal; (3) mengembangkan dan mempromosikan pangan lokal menjadi komoditas unggulan sebagai salah satu upaya peningkatan pendapatan masyarakat dampingan melalui berbagai usaha tani dan usaha produktif lainnya dengan bermitra pada pihak lain; (4) memperjuangkan adanya komitmen pemerintah, swasta dan LSM serta semua pihak untuk memiliki kepedulian terhadap masalah kekerasan terhadap perempuan dan anak, termasuk buruh migran dalam melakukan perubahan dan pembuatan kebijakan yang tidak diskriminatif serta melestarikan nilai-nilai budaya yang berpihak pada keadilan gender dalam rangka mengimbangi budaya luar yang merugikan masyarakat dan (5) meningkatkan kapasitas staf terkait dengan bidang-bidang yang digeluti SSP dan merekrut staf yang sesuai dengan latar belakang pendidikan dan keahlian yang dibutuhkan oleh lembaga serta mengupayakan peluang- peluang kemitraan dengan pihak pemerintah, swasta, INGO, NGO dan pihak lainnya yang tidak mengikat termasuk fundraising mandiri lembaga demi mendukung tersedianya sarana-prasarana yang memadai untuk melaksanakan pelayanan yang optimal dan berkelanjutan.
Tujuan yang ingin dicapai oleh organisasi adalah meningkatkan kapasitas sumber daya manusia dalam rangka terwujudnya pelayanan bagi perempuan dan anak korban kekerasan. YSSP berfungsi bebagai pusat komunikasi dan informasi Gender, kesehatan reproduksi, kekerasan terhadap perempuan dan HAM. YSSP bertujuan peningkatan kapasitas sumber daya perempuan, dan peningkatan pengetahuan dan ketrampilan dalam rangka peningkatan ekonomi rakyat yang adil gender.